ゲノム中には、塩基配列が類似したミニサテライトが多数あります。これらのミニサテライトは、1つのプローブ（多領域ミニサテライトプローブ）で同時に検出することができます。その場合は、サザンフィルター上に 10～20本のミニサテライトのバンドが検出され、そのパターンをDNAフィンガープリントと呼びます。非常に多様性に富むので、個人識別に有用です。