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Zhenqiu Liu

所属

統計部
E-mail: zhenqiu_l@rerf.or.jp

研究者について

Liu 研究員は統計部主任研究員として赴任しました。放影研赴任前はペンシルバニア州立大学公衆衛生科学部バイオインフォマティクス部門の准教授でした。それ以前は、2013年から2018年までシダーズ・シナイ医療センターのバイオインフォマティクス部門長・准教授、2005年から2013年までメリーランド大学医学部の助教・准教授を務めています。研究テーマはバイオインフォマティクス、計算医学、およびデータサイエンスの広範な分野に渡っています。具体的に行っている研究は、マルチオミクス統合とリスク予測のための統計・機械学習手法、シングルセルシークエンス解析手法、および放射線ゲノミクスにおける因果推論とバイオマーカー同定です。また、実験研究、バイオマーカー評価、オミクス、および臨床・疫学研究において広い共同研究の経験を有しています。

学歴

2002
Ph.D.（オペレーションズ・リサーチ、経営科学）、テネシー大学（米国テネシー州ノックスビル）
2002
M.S.（コンピューターサイエンス）、テネシー大学（米国テネシー州ノックスビル）
1989
M.S.（応用数学）、山東大学（中国山東省）
1986
B.E.（応用地球物理学）、吉林大学（中国吉林省）

職歴

放射線影響研究所　統計部
  • 2022-現在

    統計部　主任研究員

ペンシルバニア州立大学医学部（米国ペンシルバニア州ハーシー）
  • 2018-2022

    准教授　公衆衛生科学部バイオインフォマティクス部門

シダーズ・シナイ医療センター（米国カリフォルニア州ロサンゼルス）
  • 2013-2018

    バイオインフォマティクス部門長・准教授　サミュエルオースチン総合がん研究所

メリーランド大学医学部（米国メリーランド州バルティモア）
  • 2010-2013

    准教授　疫学公衆衛生学部バイオインフォマティクス・生物統計学科

  • 2005-2010

    助教　疫学公衆衛生学部バイオインフォマティクス・生物統計学科

オハイオ州立大学（米国オハイオ州コロンバス）
  • 2004-2005

    博士研究員（統計遺伝学・バイオインフォマティクス）統計学部

米国陸軍医学研究資材コマンド（USAMRMC）（米国メリーランド州フレデリック）
  • 2003-2004

    博士研究員（バイオインフォマティクス）遠隔医療・先端技術研究センター

テネシー大学（米国テネシー州ノックスビル）
  • 2002-2003

    シニアコンピュータプログラマー 地域医療研究グループ

主な研究論文

Liu Z. Clustering Single-Cell RNA-Seq Data with Regularized Gaussian Graphical Model. Genes (Basel). 2021 Feb 22; 12(2):311. doi: 10.3390/genes12020311.
Liu Z. Visualizing Single-Cell RNA-seq Data with Semi-supervised Principal Component Analysis. Int J Mol Sci. 2020 Aug 12; 21(16):5797. doi: 10.3390/ijms21165797.
Liu Z, Elashoff D, Piantadosi S. Sparse support vector machines with L0 approximation for ultra-high dimensional omics data. Artif Intell Med. 2019 May; 96:134-141. doi: 10.1016/j.artmed.2019.04.004.
Liu Z, Sun F, McGovern DP. Sparse Generalized Linear Model with L0 Approximation for Feature Selection and Prediction with Big Omics Data. Biodata Mining. 2017 Dec 19; 10:39. doi: 10.1186/s13040-017-0159-z.
Liu Z, Lin S, Deng N, McGovern D, Piantadosi S. Sparse inverse covariance estimation with L0 Penalty for Network Construction with Omics Data. Journal of Computational Biology. 2016 Mar; 23(3):192-202.
Liu Z, Sun F, Braun J, McGovern D, Piantadosi S. Multilevel Regularized Regression for Simultaneous Taxa Selection and Network Construction with Metagenomic Count Data. Bioinformatics. 2014 Nov 20.
Liu Z, Hsiao W, Cantarel BL, Drábek EF, Fraser-Liggett C. Sparse Distance Based Learning for Simultaneous Multiclass Classification and Feature Selection of Metagenomic Data. Bioinformatics. 2011 Oct 7.
Liu Z, Lin S, Tan M. Sparse support vector machine with Lp penalty for biomarker discovery. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB). 2010 Jan-Mar; 7(1): 100-7.
Liu Z, Tan M. ROC Based Utility function Maximization for Feature Selection and Classification with Application to High Dimensional protease Data. Biometrics. 2008 Mar 24.
Liu Z, Lin, S. Multiplies LD measure and tagging SNP selection with generalized mutual information. Genetic Epidemiology. 2005; vol.19, 4, (353-364).

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